第109回薬剤師国家試験 問106 乳酸脱水素酵素活性中心とピルビン酸還元機構

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■ 正解
1、4


■ 問題の本質(LDH活性中心での電子・プロトンのやり取り)

乳酸脱水素酵素(LDH)は、

  • ピルビン酸のカルボニル炭素に対する求電子性の調整
  • NADH からのヒドリド(H⁻)移動
  • His 残基によるプロトン授受
  • Arg 残基によるカルボキシラートの静電的固定

などで、ピルビン酸 → L-乳酸への還元を触媒している。 各残基の役割を正しく理解しているかを問う問題。


■ 各選択肢の検証

● 1 109番のArgはピルビン酸のカルボニル炭素の求電子性を高めている(正)
Arg(アルギニン)の側鎖グアニジニウム基は正電荷をもち、

  • ピルビン酸のカルボニル酸素やカルボキシラートと静電相互作用・水素結合を形成
  • 電子を酸素側に引き寄せ、カルボニル炭素の求電子性を高める

これにより、NADH からのヒドリド攻撃が起こりやすくなる。

→ 記述は正しい。


● 2 168番のアミノ酸残基はアスパラギンである(誤)
図中の 168 番残基は、側鎖構造から見てアスパラギン(Asn)ではない

アスパラギンなら –CH₂–CONH₂ のアミド側鎖だが、 提示構造はそれと一致しない。

→ 誤。


● 3 171番のArgとピルビン酸との主たる相互作用は、分散力によるものである(誤)
Arg171 は側鎖に正電荷をもつグアニジニウム基を持ち、

  • ピルビン酸のカルボキシラート(–COO⁻)と静電相互作用・イオン結合を形成

するのが主たる役割である。

「分散力(ファンデルワールス力)」が主ではなく、 静電的相互作用が本質。

→ 誤。


● 4 195番のHisはピルビン酸に対してブレンステッド酸としてはたらく(正)
His195 は、

  • NADH からのヒドリド移動で生成するアルコキシ中間体
  • ピルビン酸のカルボニル酸素

に対して、プロトンを与えることで、

  • ブレンステッド酸(プロトン供与体)として働き、L-乳酸の –OH 形成に関与する

→ 記述は正しい。


● 5 NADHはピルビン酸に対してプロトン供与体としてはたらく(誤)
NADH は、

  • ピリジン環からヒドリドイオン(H⁻)を供与する

のが本質であり、

  • 「プロトン(H⁺)供与体」ではない

プロトンの授受は主に His などのアミノ酸残基が担う。

→ 誤。


■ まとめ

  • Arg109:正電荷でカルボニル周辺を極性化し、求電子性を高める(1:正)。
  • His195:ピルビン酸(および中間体)にプロトンを与えるブレンステッド酸として働く(4:正)。
  • Arg171:主相互作用は静電相互作用であり、分散力ではない(3:誤)。
  • NADH はヒドリド供与体であり、プロトン供与体ではない(5:誤)。

正解は 1 と 4

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